Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms