Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlgn1Q99K10 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms