Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Derl1Q99J56 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Derl1Q99J56 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms