Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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