Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ttc8Q8VD72 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc8Q8VD72 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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