Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phc3Q8CHP6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phc3Q8CHP6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phc3Q8CHP6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phc3Q8CHP6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phc3Q8CHP6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phc3Q8CHP6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Phc3Q8CHP6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Phc3Q8CHP6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Phc3Q8CHP6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Phc3Q8CHP6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Phc3Q8CHP6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms