Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms