Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhsl1Q8CAF4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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