Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ctdsp2Q8BX07 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ctdsp2Q8BX07 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ctdsp2Q8BX07 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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