Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc30Q8BVF4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc30Q8BVF4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc30Q8BVF4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc30Q8BVF4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc30Q8BVF4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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