Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms