Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms