Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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