Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmeff1Q6PFE7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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