Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms