Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms