Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf280dQ68FE8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf280dQ68FE8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf280dQ68FE8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Znf280dQ68FE8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Znf280dQ68FE8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Znf280dQ68FE8 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf280dQ68FE8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf280dQ68FE8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Znf280dQ68FE8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Znf280dQ68FE8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf280dQ68FE8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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