Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms