Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r223Q5SSA0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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