Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms