Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Slc27a5Q4LDG0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc27a5Q4LDG0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms