Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc114Q3UX62 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc114Q3UX62 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc114Q3UX62 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc114Q3UX62 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms