Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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