Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Snx27Q3UHD6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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