Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U595 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U595 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U595 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U595 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U595 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Q3U595 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Q3U595 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Q3U595 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Q3U595 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Q3U595 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Q3U595 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Q3U595 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Q3U595 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U595 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U595 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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