Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms