Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Otud5Q3U2S4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otud5Q3U2S4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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