Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tmem35bQ3U0Y2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tmem35bQ3U0Y2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms