Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trappc13Q3TIR1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trappc13Q3TIR1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trappc13Q3TIR1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trappc13Q3TIR1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trappc13Q3TIR1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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