Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms