Protein–RNA interactions for Protein: Q30KP3

Defb20, Beta-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb20Q30KP3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms