Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms