Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms