Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NrepQ07475 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms