Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col1a2Q01149 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms