Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms