Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms