Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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