Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms