Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcbp1P60335 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms