Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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