Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CartptP56388 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms