Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms