Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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