Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aqp4P55088 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aqp4P55088 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms