Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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