Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms