Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms