Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18530 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18530 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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