Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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P18525 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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P18525 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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P18525 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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P18525 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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